Detalhe da pesquisa
1.
Discovery of Next-Generation Antimicrobials through Bacterial Self-Screening of Surface-Displayed Peptide Libraries.
Cell
; 172(3): 618-628.e13, 2018 01 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29307492
2.
Growth-dependent Gene Expression Variation Influences the Strength of Codon Usage Biases.
Mol Biol Evol
; 40(9)2023 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37619989
3.
Metagenomic discovery of CRISPR-associated transposons.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(49)2021 12 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34845024
4.
Humanization of yeast genes with multiple human orthologs reveals functional divergence between paralogs.
PLoS Biol
; 18(5): e3000627, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32421706
5.
Mistranslation-induced protein misfolding as a dominant constraint on coding-sequence evolution.
Cell
; 134(2): 341-52, 2008 Jul 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18662548
6.
Evidence for Widespread Class II Microcins in Enterobacterales Genomes.
Appl Environ Microbiol
; 88(23): e0148622, 2022 12 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36394322
7.
Causes of evolutionary rate variation among protein sites.
Nat Rev Genet
; 17(2): 109-21, 2016 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26781812
8.
Learning the local landscape of protein structures with convolutional neural networks.
J Biol Phys
; 47(4): 435-454, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34751854
9.
The Many Nuanced Evolutionary Consequences of Duplicated Genes.
Mol Biol Evol
; 36(2): 304-314, 2019 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30428072
10.
Site-Specific Amino Acid Distributions Follow a Universal Shape.
J Mol Evol
; 88(10): 731-741, 2020 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33230664
11.
Moderate Amounts of Epistasis are Not Evolutionarily Stable in Small Populations.
J Mol Evol
; 88(5): 435-444, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32350572
12.
Pinetree: a step-wise gene expression simulator with codon-specific translation rates.
Bioinformatics
; 35(20): 4176-4178, 2019 10 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30923831
13.
Assessment of Raman Spectroscopy for Reducing Unnecessary Biopsies for Melanoma Screening.
Molecules
; 25(12)2020 Jun 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32575717
14.
Within-Gene Shine-Dalgarno Sequences Are Not Selected for Function.
Mol Biol Evol
; 35(10): 2487-2498, 2018 10 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30085185
15.
Functional Sites Induce Long-Range Evolutionary Constraints in Enzymes.
PLoS Biol
; 14(5): e1002452, 2016 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27138088
16.
Phylogenetic weighting does little to improve the accuracy of evolutionary coupling analyses.
Entropy (Basel)
; 21(10)2019 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31662602
17.
Limitations of alignment-free tools in total RNA-seq quantification.
BMC Genomics
; 19(1): 510, 2018 Jul 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29969991
18.
Predicting an epidemic trajectory is difficult.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(46): 28549-28551, 2020 11 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33144506
19.
Large-scale analysis of post-translational modifications in E. coli under glucose-limiting conditions.
BMC Genomics
; 18(1): 301, 2017 04 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28412930
20.
Extensively Parameterized Mutation-Selection Models Reliably Capture Site-Specific Selective Constraint.
Mol Biol Evol
; 33(11): 2990-3002, 2016 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27512115